Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALS2CLQ60I27 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALS2CLQ60I27 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms