Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1QL3Q5VWW1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms