Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BROXQ5VW32 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms