Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
AGAP9Q5VTM2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AGAP9Q5VTM2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms