Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOGA3Q5TF21 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
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