Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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FREM1Q5H8C1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FREM1Q5H8C1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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