Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAVIN4Q5BKX8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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