Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms