Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D3Q587I9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D3Q587I9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms