Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB6CQ53S08 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms