Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL12Q53G59 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms