Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXD4L6Q3SYB3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXD4L6Q3SYB3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms