Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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TNXAQ16473 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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TNXAQ16473 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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TNXAQ16473 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TNXAQ16473 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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TNXAQ16473 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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TNXAQ16473 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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TNXAQ16473 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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TNXAQ16473 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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TNXAQ16473 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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TNXAQ16473 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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TNXAQ16473 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TNXAQ16473 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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TNXAQ16473 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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