Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A1Q15459 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A1Q15459 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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