Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARB2Q14108 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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