Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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