Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CAPSQ13938 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms