Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBA3CQ13748 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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