Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTR4Q13639 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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