Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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