Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NAE1Q13564 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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NAE1Q13564 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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NAE1Q13564 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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NAE1Q13564 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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NAE1Q13564 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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NAE1Q13564 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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NAE1Q13564 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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NAE1Q13564 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NAE1Q13564 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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