Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC1Q13547 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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