Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MSLNQ13421 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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