Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE3BQ13370 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE3BQ13370 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
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