Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF1Q13351 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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