Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SKP2Q13309 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SKP2Q13309 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SKP2Q13309 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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SKP2Q13309 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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SKP2Q13309 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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SKP2Q13309 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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