Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF2Q12933 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms