Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMAGPQ0VAQ4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms