Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP4Q09028 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RBBP4Q09028 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms