Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD47Q08722 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD47Q08722 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD47Q08722 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD47Q08722 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD47Q08722 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD47Q08722 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD47Q08722 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD47Q08722 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD47Q08722 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD47Q08722 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD47Q08722 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms