Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CD300CQ08708 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms