Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LRP1Q07954 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms