Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCN1BQ07699 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms