Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PAX8Q06710 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms