Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTDSPL2Q05D32 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTDSPL2Q05D32 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms