Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN12Q05209 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms