Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP1Q04837 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSBP1Q04837 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP1Q04837 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms