Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 APCDD1L-AS1-204ENST00000427794 461 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 LINC01284-201ENST00000442994 730 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC022486.1-201ENST00000510613 1483 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CSTA-202ENST00000479204 821 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC096751.2-201ENST00000507483 792 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 ARL1-203ENST00000539055 1231 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNB1Q02641 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms