Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF8Q02556 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms