Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NRG1Q02297 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NRG1Q02297 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms