Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XPCQ01831 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XPCQ01831 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XPCQ01831 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPCQ01831 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPCQ01831 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPCQ01831 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPCQ01831 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPCQ01831 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XPCQ01831 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms