Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTBN1Q01082 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms