Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBP5P82980 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBP5P82980 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBP5P82980 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBP5P82980 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBP5P82980 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBP5P82980 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBP5P82980 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBP5P82980 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBP5P82980 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBP5P82980 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBP5P82980 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBP5P82980 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms