Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HERVK_113P62684 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERVK_113P62684 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms