Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHMP4BP1P59074 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms