Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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