Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRIM1P49642 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRIM1P49642 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms