Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM4P49221 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM4P49221 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM4P49221 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM4P49221 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM4P49221 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM4P49221 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM4P49221 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM4P49221 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM4P49221 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM4P49221 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM4P49221 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM4P49221 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM4P49221 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TGM4P49221 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGM4P49221 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGM4P49221 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGM4P49221 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGM4P49221 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGM4P49221 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGM4P49221 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGM4P49221 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGM4P49221 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TGM4P49221 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGM4P49221 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TGM4P49221 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TGM4P49221 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms