Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms