Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AFMP43652 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AFMP43652 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AFMP43652 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AFMP43652 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AFMP43652 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AFMP43652 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AFMP43652 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms